Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms