Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx3Q9JKB3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms