Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms