Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ddx20Q9JJY4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddx20Q9JJY4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms