Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra4Q9JJT2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms