Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Copb1Q9JIF7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms