Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tcirg1Q9JHF5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms