Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rb1cc1Q9ESK9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rb1cc1Q9ESK9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rb1cc1Q9ESK9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rb1cc1Q9ESK9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rb1cc1Q9ESK9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
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