Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Capn10Q9ESK3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms