Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OtofQ9ESF1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OtofQ9ESF1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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