Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms