Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc4Q9ES56 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc4Q9ES56 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms