Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ube3bQ9ES34 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3bQ9ES34 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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