Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms