Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r29Q9EQ41 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms