Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms