Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf1Q9EPU4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms