Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgap1Q9EPJ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms