Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rarres2Q9DD06 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres2Q9DD06 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres2Q9DD06 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres2Q9DD06 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rarres2Q9DD06 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rarres2Q9DD06 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms