Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnft1Q9DCN7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft1Q9DCN7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms