Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif3fQ9DCH4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms