Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc46a3Q9DC26 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms