Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms