Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms