Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem43Q9DBS1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem43Q9DBS1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms