Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38bQ9DAV9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms