Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA6

Exosc1, Exosome complex component CSL4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc1Q9DAA6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc1Q9DAA6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc1Q9DAA6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms