Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph3bQ9DA80 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph3bQ9DA80 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph3bQ9DA80 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph3bQ9DA80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph3bQ9DA80 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph3bQ9DA80 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph3bQ9DA80 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph3bQ9DA80 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph3bQ9DA80 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph3bQ9DA80 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph3bQ9DA80 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms