Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc89Q9DA73 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc89Q9DA73 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms