Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pdzd9Q9D9M4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd9Q9D9M4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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