Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms