Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e2Q9D902 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms