Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hm13Q9D8V0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms