Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SlirpQ9D8T7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms