Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms