Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms