Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl4Q9D8E6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms