Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ifi35Q9D8C4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ifi35Q9D8C4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi35Q9D8C4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms