Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms