Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cyp2c55Q9D816 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms