Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms