Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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