Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam227bQ9D518 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms