Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc130Q9D516 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms