Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms