Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930564D02RikQ9D4S4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms