Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ribc2Q9D4Q1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ribc2Q9D4Q1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ribc2Q9D4Q1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ribc2Q9D4Q1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ribc2Q9D4Q1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ribc2Q9D4Q1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ribc2Q9D4Q1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ribc2Q9D4Q1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ribc2Q9D4Q1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ribc2Q9D4Q1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc2Q9D4Q1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms