Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmntd1Q9D4C1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmntd1Q9D4C1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms