Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D454 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D454 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D454 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D454 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D454 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D454 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D454 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D454 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D454 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D454 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D454 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D454 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D454 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D454 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D454 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D454 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D454 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D454 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D454 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms