Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms